Circos流程记录  最近要用到Circos进行绘图，因此进行记录，方便下次绘图。 0. 软件安装  Circos基于Perl，所以我们需要进行大量Perl包的安装。当然，秉着赌狗的心理，我们看看能

使用SYRI鉴定基因组变异及可视化1.调整两条比对基因组的染色体方向SYRI对比对的基因组有非常严格的要求： 两个基因组的染色体ID必须一一对应(同源染色体ID必须一致，染色体数量也必须一致，染色体ID不能是数字)； 同源染色体stra

1.conda 环境配置# conda env conda create -n ncRNA conda activate ncRNA # download infernal conda install -c bioconda infern

1.引言    我们在基因组的组装过程中可能需要手动检查的情况，直接对初始的组装结果进行手动矫正，而这个脚本就是用来做这个的。这些都是在原序列的基础上操作的，我检查了几个例子是没问题的，但是用的时候还

一些常用的从 github 上安装 R 包的方法: # 1. devtools install.packages("devtools", dep=TRUE) library(devtools) install

0.前言  在做真菌的一些生信分析中，可能需要真菌的繁殖方式的信息。真菌的繁殖方式主要有两种：同宗配合与异宗配合，自然界中绝大多数的情况下都是异宗配合。控制真菌交配型的基因主要有两种： MAT1-1 和 MAT1-2，异

0. 环境配置cd /data/chaofan/software/ git clone https://github.com/stschiff/msmc2.gi

用来简单记录下GERP的过程，方便后续再次使用。 1. 环境准备# 下载cactus ## 一般在自己本地的soft文件夹下进行 wget https://github.com/ComparativeGenom

群体遗传学概念我的记忆力实在是太差了(金鱼?.?)，为了更深一步的巩固自己的记忆，加深一些概念的理解，固有此。本人能力有限，如理解有问题恳请及时纠正！ 1. π (pi) 核苷酸多样性用来衡量核苷酸多样性的大小，越大，说明群体多样性越高。目

第二章 基本数学运算第一讲简单的介绍了numpy的一些常用的属性和使用matplot绘制曲线图、修改曲线的类型、添加图例lable和更改x|y轴坐标等。详细参数说明 import numpy as np import matplotlib.